ในการหาลำดับกรดอะมิโนของเพปไทด์ สามารถทำได้โดยการวิเคราะห์
กรดอะมิโนองค์ประกอบ (amino acid composition) การวิเคราะห์ปลายด้านหมู่อะมิโน (N-terminal group analysis) และการวิเคราะห์หมู่คาร์บอกซิล
( C- terminal group analysis ) ร่วมกับการใช้เอนไซม์บางชนิดในการตัด
พันธะเพปไทด์อย่างจำเพาะ แสดงดังภาพ เพปไทด์ที่มีลำดับกรดอะมิโน
Gln - Gly - Val - Cys - Ala - Lys - Ser - Gly - Ile - Arg
มีจำนวนจุดตัดเอนไซม์ข้างต้นเท่าใด (9สามัญ’63)