Repaso Parcial I

Si quieres información bibliográfica, ¿cuál es el mejor sitio web para visitar?

• Pubmed
• ENA
• Uniprot
• NCBI

Si queremos ver el número de líneas del archivo file.fasta ¿Qué comando usamos?

• lines file.fasta
• wc -l file.fasta
• cat file.fasta
• wc file.fasta

Señale la opción falsa en cuanto a matrices de sustitución:

• Se utilizan como parámetros en algoritmos de alineamiento
• Son un sistema de puntuación y penalización para el alineamiento de secuencias
• La primera matriz de sustitución se desarrolló en los años 70 por M. Dayhoff
• Sólo las matrices PAM250, PAM30 y PAM70 son validadas

¿Cuál de los siguientes es un algoritmo basada en caracteres para reconstrucción filogenética?

• Kimura
• neighbour-joining
• Máxima verosimilitud
• UPGMA

Sobre los modelos de evolución, seleccione la opción falsa.

• Jukes-Cantor es un modelo de evolución
• Son descripciones matemáticas de la evolución de las secuencias.
• Existen diversos modelos dependiendo del número de parámetros o supuestos que se estudien.
• Blosum69 es un modelo de evolución

¿Por qué se tienen que normalizar los datos de microarrays?

• Para corregir el background (ruido de fondo)
• Algunos experimentos usan ADNc marcado con fluorescencia mientras que otros emplean ADNc marcado con radiactividad.
• Para asegurar que los resultados son válidos
• Para eliminar el uso de housekeeping genes

¿Cómo se insertan comentarios en R?

• Mediante el símbolo @
• Mediante el símbolo /
• Mediante el símbolo #
• Mediante el símbolo ?

¿Cuál de los siguientes lenguajes de programación es un ejemplo de lenguaje de alto nivel?

• D
• Python
• Ensamblador
• Lenguaje de máquina

Sobre los paquetes de R... ¿qué opción es falsa?

• Si no se cargan no se pueden usar sus métodos.
• Para cargarlos hay que usar el comando install.packages(nombre_del_paquete)
• Son contenedores de funciones y (opcionalmente) datos
• Están alojados en repositorios desde donde se descargan

Selecciona la afirmación CORRECTA sobre las bases de datos revisadas:

• Están centradas en un campo de investigación concreto
• Los autores introducen datos libremente
• Contienen datos directos de la experimentación
• Los revisores controlan la calidad de los datos