Sinh tin. Chương 4 part 2

BioEdit là phần mềm dùng để làm gì trong tin sinh học?

• Phân tích cấu trúc protein

• Xử lý và chỉnh sửa tệp FASTA

• Dự đoán mô hình 3D của protein

• Phân tích biểu hiện gen từ RNA-Seq

BioEdit là phần mềm miễn phí dùng để làm gì?

• Soạn thảo văn bản

• Chỉnh sửa và phân tích dữ liệu sinh học

• Phát triển phần mềm

• Tạo đồ họa

Bước chuyển RNA thành cDNA trong RNA-Seq sử dụng enzyme nào?

• Reverse transcriptase

• DNA polymerase

• RNA polymerase

• Ligase

Bước đầu tiên để tải trình tự FASTA từ NCBI là gì?

• Tìm kiếm từ khóa

• Truy cập trang web NCBI

• Tải phần mềm phân tích

• Lọc kết quả tìm kiếm

Bước đầu tiên trong quá trình giải trình tự DNA là gì?

• Lưu trữ dữ liệu

• Xác định trình tự nucleotide

• Phân mảnh DNA

• So sánh trình tự DNA

Bước nào giúp loại bỏ các đoạn DNA có kích thước không phù hợp trong quá trình chuẩn bị thư viện?

• Sử dụng enzyme cắt hạn chế

• Lọc kích thước bằng gel hoặc cột lọc

• Dùng nhiệt để phân hủy DNA không mong muốn

• Biến tính DNA thành sợi đơn

Bước nào sau đây KHÔNG thuộc quy trình giải trình tự NGS?

• Chuẩn bị thư viện DNA/RNA

• Nhân bản plasmid trong vi khuẩn

• Giải trình tự song song

• Phân tích dữ liệu

Bước nào sau đây xảy ra sau khi DNA được gắn lên flowcell trong công nghệ Illumina?

• DNA được nhân lên bằng Bridge PCR

• DNA được giải trình tự ngay lập tức

• DNA được biến tính để tạo ra RNA

• DNA bị cắt thành các đoạn nhỏ hơn

Bước xử lý dữ liệu thô trong NGS KHÔNG bao gồm công việc nào sau đây?

• Loại bỏ các đoạn đọc chất lượng thấp

• Cắt bỏ adapter

• Kiểm tra độ chính xác (QC)

• Tổng hợp RNA từ DNA

Các ddNTPs trong phương pháp Sanger được đánh dấu bằng gì để xác định trình tự nucleotide?

• Đồng vị phóng xạ

• Màu huỳnh quang

• Enzyme đặc hiệu

• Kháng thể đặc hiệu