CRISPR Quiz

CRISPR bermula sebagai:

• sistem imun adaptif sel bakteri

• ingatan molekular dari ragi

• catatan kimiawi infeksi bakteri

• sistem kekebalan eukariot tingkat rendah

• mimpi buruk para ilmuwan

Molekul mana sajakah yang terlibat dalam penggunaan CRISPR sebagai mekanisme penyuntingan gen pada sel manusia?

• protein Cas9

• gRNA

• nuklease

• DNA polimerase

CRISPR merupakan singkatan dari ...

• Clustered Regularly Interspaced Sequence Polymorphism Repeats

• Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats

• Clustered Ribosomal Interspersed Structured Polymorphism Repeats

• Clustered Randomly Interspersed Short Palindromic Repeats

• Clustered Randomly Interspaced Structural Palindromic Repeats

RNA yang digunakan peneliti untuk mengarahkan protein Cas9 ke gen sasaran disebut ...

Pada mekanisme perbaikan double-strand break (DSB), enzim yang berperan untuk menempelkan ujung-ujung DNA yang terpotong adalah ...

• DNA polimerase

• nuklease

• primase

• ligase

Answer explanation

Nuklease berfungsi memotong ujung-ujung DNA yang patah, namun yang menyambungkan kedua ujung adalah ligase.

BENAR ATAU SALAH:

Mekanisme perbaikan kerusakan DNA homologous-directed repair (HDR) lebih akurat ketimbang nonhomologous end-joining (NHEJ).

• Benar

• Salah

Answer explanation

Homologous-directed repair (HDR) menggunakan suatu template khusus sehingga akan lebih akurat. Nonhomologous end-joining (NHEJ) hanya akan memotong ujung-ujung untai DNA yang rusak sehingga mengakibatkan hilangnya atau penambahan basa nitrogen (insertion or deletion, indel).

Ada berapa domain pemotongan DNA (nuklease) pada protein Cas9?

• 1

• 2

• 3

• 4

• 5

Answer explanation

Ada 2 domain, masing-masing memotong satu untai DNA sehingga dapat terbentuk double-strand break (DSB).

BENAR ATAU SALAH?

Untuk memperbaiki mutasi titik (point mutation) yang mengakibatkan anemia sel sabit (sickle cell anemia), dapat digunakan nonhomologous end joining (NHEJ) sebagai metode perbaikan double-strand break (DSB)

• Benar

• Salah

Answer explanation

Akan lebih baik menggunakan metode homology-directed repair (HDR) untuk menggunakan DNA template yang membawa sekuens yang benar untuk memperbaiki gen yang defektif tersebut.

BENAR ATAU SALAH?

Untuk menginaktivasi suatu gen, metode nonhomologous end joining lebih menguntungkan ketimbang homology-directed repair.

• Benar

• Salah

Answer explanation

NHEJ mengakibatkan insersi atau delesi (indel) pasangan basa yang akan mengakibatkan frameshift mutation, sehingga menginaktivasi gen target.

Pada organisme mana sajakah CRISPR dapat ditemukan?

• Ragi (Saccharomyces cerevisiae)

• Eubacteria

• Archaebacteria

• Protozoa

• Animalia