29.01.2022-Dr. Şeyma Gökdemir- Biyoinformatiğe giriş

Aşağıdakilerden hangisi biyoinformatiğin başlıca çalışma alanlarından değildir?

• Genom anlamlandırması

• Evrim çalışmaları

• Kanserde mutasyonların belirlenmesi

• Gen ifadesi analizi çalışmaları

• R, Java, Phyton gibi yazılım dillerinin ticari ürüne dönüştürülmesi

Çeşitli yazılım dillerinin geliştirilmesi üzerine Mark Andersen tarafından yorum hangisidir?

• "Yazılım dünyayı yiyor.”

• ”Yazılım dünyanın en popüler bilim dalıdır.”

• ”Yazılım bir kodlama yığınıdır.”

• “Yazılım uzayı yakına getiriyor.”

• “Yazılım WEB’in yara bandıdır.”

Homoloji terimi neyi ifade etmektedir?

• Birden çok dizinin benzer olduğu yerlerdir.

• Benzerlik oranıdır.

• İki dizinin eşleştiği yerlerdir.

• İki dizinin eşleştiği yerlerdeki boşluklardır.

• İki dizinin ekson-intron sayılarının uyumudur.

Aşağıdakilerden hangisi bir veri tabanı değildir?

• Protein veri tabanı (PDB) 

• NCBI

• LİNUX

• ESEMBL

• GENBANK

Bir gen veya proteinle ilgili olarak NCBI üzerinden ulaşamayacağınız bilgi hangisidir?

• Genom dizisi

• Açık okuma (ORF) bölgeleri

• Telomeraz uzunlukları

• Protein sekansı

• Primer dizileri

Basit işlemler için veri tabanlarında kullanılan genel dosya formatı hangisidir?

• Genbank formatı

• Matris formatları

• Fasta

• Eşleştirme formatı

• BAM formatı

Prokaryot bir genomda ORF tahminlemesinde hangi parametreler önemli değildir?

• Başlangıç kodonu

• Ekson-İntron bölgeleri

• % GC içeriği 

• Bitiş kodonu

• Shine-Dalgarno dizisi

Aşağıdakilerden hangisi filogenetik ağaç çiziminde kulanılan yöntemlerden biri değildir?

• Neighbor Joining

• Maksimum Likelihood

• Diferansiyel Hibridizasyon

• Bayesian Analizi

• Fitch Margolish

Aşağıdakilerden hangisi bir protein dizisinin bir parçasıdır?

• ATTTGCTAASGTGTGA

• USGAAAGGUUSGUA

• MSEFVMSVMMFS

• TTATATATATATAAA

• AUGUASMRTASG

Aşağıdakilerden hangisi bir yazılım dil değildir?

• R

• Phyton

• Java

• Ensembl

• C++