BLAST

BLAST es una abreviación de

• Basic Local Alignment Search Tool

• Basic Logical Alignment Search Tool

• Best Logical Alignment Search Tool

• Best Local Alignment Search Tool

En qué algoritmo se basa BLAST

• Needleman Waterman

• Needleman Wunsch

• Smith Waterman

• Smith Wunsch

Para buscar una secuencia query de nucleótidos contra una base de datos de nucleótidos, utilizamos

• BLASTP

• BLASTN

• BLASTX

• TBLASTX

Para buscar una secuencia query de aminoácidos contra una base de datos de proteínas utilizamos

• BLASTP

• BLASTN

• BLASTX

• TBLASTN

Un "high score segment pair" es

• Un alineamiento que se produce extendiendo un alineamiento seed hasta los extremos de las secuencias

• Un alineamiento que se produce extendiendo un alineamiento seed hasta que el puntaje cae por debajo de cierto threshold

Un alineamiento con E value de 10 es más significativo que uno de E value 0.1

• Verdadero

• Falso

El E-value se define como ..... score mayor o igual a S

• el número de alineamientos aleatorios con

• la probabilidad de que un alineamiento generado al azar tenga un

• el número esperado de HSPs verdaderos positivos con

• la probabilidad de que la matriz de sustitución tenga un

Para aumentar la sensibilidad de una búsqueda mediante BLAST puedo

• Aumentar w

• Aumentar el threshold

• Disminuir el threshold

• Aumentar el tiempo de búsqueda